Mục đích:

- Phát hiện thể dị bội nhiễm sắc thể và đột biến gen.

-  Phân tích sự phân bố nhiễm sắc thể ở kỳ giữa.

Ưu điểm công nghệ: 

- Nhanh và đơn giản hơn so với phương pháp IHC.

- Quan sát đồng thời hình thái mô học và tín hiệu CISH.

- Lưu trữ các slides ở nhiệt độ phòng, tín hiệu rất bền.

- Không yêu cầu kính hiển vi huỳnh quang đắt tiền.​

Đặc điểm:

- Phát hiện hai mục tiêu cùng lúc.

- Sử dụng tín hiệu tương phản (Đỏ, xanh) dễ phân biệt.

- Quan sát ở vật kính 40X trên kính hiển vi quang học​.